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单个癌症治疗靶点准确预测的共识算法

文章出处:未知 责任编辑:PD-1编辑王 作者:PD-1编辑王 发表时间:2018-01-04 11:15

新加坡的科学家们已经就如何治疗癌症做了一个独特的发现 - 在确定癌症治疗目标时,最好是听取许多计算机程序而不是一个。研究人员已经开发了一种先进的系统,通过强大的共识算法将这种“人群的智慧”整合在一起,以隔离每个癌症肿瘤的致命弱点,帮助科学家更好地研究不同的癌症并确定目标治疗方案。

癌细胞有数以千计的遗传病变,但只有少数这些突变引起肿瘤。识别促进体内癌细胞失控增长的“驱动因素”突变是精确肿瘤新兴领域面临的主要挑战。这是科学家们首次发现了一种将各种专家系统整合为单个癌症治疗靶点准确预测的共识算法。

为了开发这个系统,研究人员分析了超过3000种肿瘤的数据,涵盖了15种不同的癌症类型,包括结肠癌,乳腺癌,肺癌,胃癌和肝癌。他们研究了18种不同的现有算法,发现他们中的每一个都不能识别相当大比例的患者中的驱动突变。此外,在60%以上的患者中,没有一种方法能够确定可治疗的驱动因素。通过指出这些方法具有非常不同的优势,并将它们结合起来,这个称为共识驱动程序(ConsensusDriver)的新系统能够在几乎所有研究的患者中确定治疗目标,其中80%可以用现有药物治疗。

这项最近发表在癌症研究(Cancer Research)上的研究由来自新加坡基因组研究所(GIS)的Denis Bertrand博士和Niranjan Nagarajan教授共同领导,研究人员包括新加坡国立癌症中心(NCCS)和国立大学新加坡(NUS)。

单个癌症治疗靶点准确预测的共识算法

癌症是全球死亡的主要原因之一,2015年造成880万人死亡,2010年估计全球经济影响约为1.16万亿美元。多年来,DNA测序技术的突破使研究人员能够确定完成癌症的基因构成。现在面临的挑战在于汲取大量数据来了解个体疾病的独特遗传基础。世界各地和新加坡的研究人员正在竞相开发新的计算机算法,并参与诸如癌症基因组图谱等大型合作项目。

地理信息系统(GIS)的职员科学家Denis Bertrand博士和这项工作的主要作者说:“开发共识驱动程序并与癌症基因组合作Atlas一直是一个令人大开眼界的经验,这是在国际范围内的协作科学,我们正在迅速取得进展能够在正确的时间给合适的病人正确的药物。“

地理信息系统副主任兼高级小组组长Nagarajan教授指出:“计算机算法已经成为抗癌的新武器,而不是用滥用药物来摧毁癌细胞,现在我们正在计算中找出遗传缺陷更精确地瞄准他们的药物“。

地理信息系统执行主任吴虎辉教授说:“ 癌症遗传学的复杂性是我们面临的最大挑战之一,通过精确识别可操作的突变,为个人量身定制治疗方法,我们正向精准医学迈进一步。我很高兴地注意到GIS科学家正在开发新的算法和技术来实现这一愿景。“

推荐阅读:http://ioc.waikong.hk/hkioc/2018/0102/5016.html

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